MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori v225d plasmid pHPv225d

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017383	A	6	6	34	39	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017383	T	10	10	41	50	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017383	A	6	6	107	112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017383	TAT	2	6	113	118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017383	TAGT	2	8	129	136	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017383	A	7	7	140	146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017383	ATC	2	6	160	165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017383	AGTT	2	8	281	288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017383	ATT	2	6	364	369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888494
10	NC_017383	GAA	2	6	447	452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888494
11	NC_017383	GAAT	2	8	455	462	50 %	25 %	25 %	0 %	384888494
12	NC_017383	ATA	2	6	500	505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888494
13	NC_017383	TTA	2	6	533	538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888494
14	NC_017383	TCAT	2	8	541	548	25 %	50 %	0 %	25 %	384888494
15	NC_017383	ACAA	2	8	563	570	75 %	0 %	0 %	25 %	384888494
16	NC_017383	AAC	2	6	621	626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888494
17	NC_017383	AAT	2	6	628	633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888494
18	NC_017383	TCA	2	6	650	655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888494
19	NC_017383	A	7	7	714	720	100 %	0 %	0 %	0 %	384888494
20	NC_017383	TAG	2	6	834	839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888494
21	NC_017383	GAT	2	6	865	870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888494
22	NC_017383	GAA	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888494
23	NC_017383	T	6	6	899	904	0 %	100 %	0 %	0 %	384888494
24	NC_017383	A	6	6	913	918	100 %	0 %	0 %	0 %	384888494
25	NC_017383	TTTG	2	8	924	931	0 %	75 %	25 %	0 %	384888494
26	NC_017383	CAA	2	6	971	976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888494
27	NC_017383	T	7	7	979	985	0 %	100 %	0 %	0 %	384888494
28	NC_017383	TTG	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888494
29	NC_017383	ATA	2	6	1085	1090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888494
30	NC_017383	GAT	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888494
31	NC_017383	A	6	6	1108	1113	100 %	0 %	0 %	0 %	384888494
32	NC_017383	T	6	6	1173	1178	0 %	100 %	0 %	0 %	384888494
33	NC_017383	CTAGC	2	10	1196	1205	20 %	20 %	20 %	40 %	384888494
34	NC_017383	ACA	2	6	1280	1285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888494
35	NC_017383	CT	3	6	1398	1403	0 %	50 %	0 %	50 %	384888495
36	NC_017383	ATT	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888495
37	NC_017383	TG	3	6	1528	1533	0 %	50 %	50 %	0 %	384888495
38	NC_017383	GTG	2	6	1555	1560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384888495
39	NC_017383	TAA	2	6	1573	1578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888495
40	NC_017383	T	8	8	1625	1632	0 %	100 %	0 %	0 %	384888495
41	NC_017383	AGA	2	6	1754	1759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384888495
42	NC_017383	CATT	2	8	1768	1775	25 %	50 %	0 %	25 %	384888495
43	NC_017383	TAC	2	6	1863	1868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888495
44	NC_017383	ATT	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888495
45	NC_017383	T	6	6	1914	1919	0 %	100 %	0 %	0 %	384888495
46	NC_017383	GAT	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384888495
47	NC_017383	TCT	2	6	1929	1934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888495
48	NC_017383	A	8	8	1945	1952	100 %	0 %	0 %	0 %	384888495
49	NC_017383	ACA	2	6	1973	1978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888495
50	NC_017383	AG	3	6	1995	2000	50 %	0 %	50 %	0 %	384888495
51	NC_017383	T	6	6	2058	2063	0 %	100 %	0 %	0 %	384888495
52	NC_017383	ACAA	2	8	2101	2108	75 %	0 %	0 %	25 %	384888495
53	NC_017383	ACT	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888495
54	NC_017383	AT	3	6	2198	2203	50 %	50 %	0 %	0 %	384888495
55	NC_017383	TACA	2	8	2306	2313	50 %	25 %	0 %	25 %	384888495
56	NC_017383	TTA	2	6	2413	2418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888495
57	NC_017383	T	6	6	2449	2454	0 %	100 %	0 %	0 %	384888495
58	NC_017383	CAC	2	6	2547	2552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888496
59	NC_017383	CAAT	2	8	2592	2599	50 %	25 %	0 %	25 %	384888496
60	NC_017383	A	7	7	2631	2637	100 %	0 %	0 %	0 %	384888496
61	NC_017383	CTT	2	6	2662	2667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888496
62	NC_017383	CT	3	6	2835	2840	0 %	50 %	0 %	50 %	384888496
63	NC_017383	TTAG	2	8	2862	2869	25 %	50 %	25 %	0 %	384888496
64	NC_017383	CTTG	2	8	2932	2939	0 %	50 %	25 %	25 %	384888496
65	NC_017383	CAT	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888496
66	NC_017383	A	7	7	2981	2987	100 %	0 %	0 %	0 %	384888496
67	NC_017383	C	6	6	2997	3002	0 %	0 %	0 %	100 %	384888496
68	NC_017383	CCA	2	6	3026	3031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384888496
69	NC_017383	TTTC	2	8	3059	3066	0 %	75 %	0 %	25 %	384888496
70	NC_017383	GT	3	6	3138	3143	0 %	50 %	50 %	0 %	384888496
71	NC_017383	CT	3	6	3175	3180	0 %	50 %	0 %	50 %	384888496
72	NC_017383	TCT	2	6	3183	3188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888496
73	NC_017383	AT	3	6	3204	3209	50 %	50 %	0 %	0 %	384888496
74	NC_017383	ACTC	2	8	3215	3222	25 %	25 %	0 %	50 %	384888496
75	NC_017383	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888496
76	NC_017383	GATT	2	8	3291	3298	25 %	50 %	25 %	0 %	384888496
77	NC_017383	TTTCTT	2	12	3316	3327	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384888496
78	NC_017383	AAAT	2	8	3404	3411	75 %	25 %	0 %	0 %	384888496
79	NC_017383	ATA	2	6	3431	3436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888496
80	NC_017383	ACA	2	6	3462	3467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888496
81	NC_017383	GGTC	2	8	3470	3477	0 %	25 %	50 %	25 %	384888496
82	NC_017383	T	7	7	3510	3516	0 %	100 %	0 %	0 %	384888496
83	NC_017383	A	7	7	3536	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	384888496
84	NC_017383	CATT	2	8	3589	3596	25 %	50 %	0 %	25 %	384888496
85	NC_017383	ATC	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888496
86	NC_017383	CACTC	2	10	3865	3874	20 %	20 %	0 %	60 %	384888496
87	NC_017383	AAT	2	6	3895	3900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888496
88	NC_017383	TCATT	2	10	3948	3957	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017383	T	6	6	3980	3985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017383	A	7	7	4004	4010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017383	TAAA	2	8	4021	4028	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017383	A	6	6	4026	4031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017383	GTC	2	6	4097	4102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017383	TTGGG	2	10	4181	4190	0 %	40 %	60 %	0 %	384888497
95	NC_017383	TTGGG	2	10	4248	4257	0 %	40 %	60 %	0 %	384888497
96	NC_017383	T	9	9	4277	4285	0 %	100 %	0 %	0 %	384888497
97	NC_017383	AG	3	6	4302	4307	50 %	0 %	50 %	0 %	384888497
98	NC_017383	A	7	7	4330	4336	100 %	0 %	0 %	0 %	384888497
99	NC_017383	A	7	7	4348	4354	100 %	0 %	0 %	0 %	384888497
100	NC_017383	CAG	2	6	4400	4405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384888497
101	NC_017383	AAC	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888498
102	NC_017383	ACCTA	2	10	4446	4455	40 %	20 %	0 %	40 %	384888498
103	NC_017383	AGC	2	6	4456	4461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384888498
104	NC_017383	GTT	2	6	4470	4475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888498
105	NC_017383	TA	3	6	4482	4487	50 %	50 %	0 %	0 %	384888498
106	NC_017383	CAA	2	6	4491	4496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888498
107	NC_017383	CT	3	6	4518	4523	0 %	50 %	0 %	50 %	384888498
108	NC_017383	TG	3	6	4548	4553	0 %	50 %	50 %	0 %	384888498
109	NC_017383	TTG	2	6	4581	4586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888498
110	NC_017383	ACT	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888498
111	NC_017383	TCA	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384888498
112	NC_017383	TTA	2	6	4618	4623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888498
113	NC_017383	TC	3	6	4692	4697	0 %	50 %	0 %	50 %	384888499
114	NC_017383	CT	3	6	4754	4759	0 %	50 %	0 %	50 %	384888499
115	NC_017383	TCTT	2	8	4808	4815	0 %	75 %	0 %	25 %	384888499
116	NC_017383	TC	4	8	4839	4846	0 %	50 %	0 %	50 %	384888499
117	NC_017383	T	6	6	4852	4857	0 %	100 %	0 %	0 %	384888499
118	NC_017383	AATC	2	8	5005	5012	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017383	AT	3	6	5047	5052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017383	A	6	6	5101	5106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017383	CAAA	3	12	5133	5144	75 %	0 %	0 %	25 %	384888500
122	NC_017383	TTA	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888500
123	NC_017383	A	7	7	5209	5215	100 %	0 %	0 %	0 %	384888500
124	NC_017383	CT	3	6	5243	5248	0 %	50 %	0 %	50 %	384888500
125	NC_017383	AAATC	2	10	5348	5357	60 %	20 %	0 %	20 %	384888500
126	NC_017383	TAA	2	6	5375	5380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384888500
127	NC_017383	CAAT	2	8	5426	5433	50 %	25 %	0 %	25 %	384888500
128	NC_017383	AAC	2	6	5437	5442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888500
129	NC_017383	GTTA	2	8	5457	5464	25 %	50 %	25 %	0 %	384888500
130	NC_017383	CTAA	2	8	5574	5581	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017383	TG	3	6	5619	5624	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017383	TGA	2	6	5654	5659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017383	CA	3	6	5705	5710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017383	AC	3	6	5747	5752	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017383	TTGAT	2	10	5794	5803	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017383	CTA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017383	ACA	3	9	5930	5938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017383	CAT	2	6	6041	6046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017383	T	6	6	6050	6055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017383	CAAGG	2	10	6084	6093	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017383	TAC	2	6	6150	6155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017383	AG	3	6	6186	6191	50 %	0 %	50 %	0 %	384888501
143	NC_017383	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	384888501
144	NC_017383	A	7	7	6353	6359	100 %	0 %	0 %	0 %	384888501
145	NC_017383	CTAGAG	2	12	6385	6396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384888501
146	NC_017383	CAA	2	6	6402	6407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888501
147	NC_017383	AG	3	6	6447	6452	50 %	0 %	50 %	0 %	384888501
148	NC_017383	CCA	2	6	6574	6579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017383	GAAC	2	8	6714	6721	50 %	0 %	25 %	25 %	384888502
150	NC_017383	GTT	2	6	6786	6791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384888502
151	NC_017383	AG	3	6	6876	6881	50 %	0 %	50 %	0 %	384888502
152	NC_017383	AC	3	6	6901	6906	50 %	0 %	0 %	50 %	384888502
153	NC_017383	ATT	2	6	6930	6935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384888502
154	NC_017383	AG	4	8	6945	6952	50 %	0 %	50 %	0 %	384888502
155	NC_017383	ACA	2	6	6993	6998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888502
156	NC_017383	TCAAA	2	10	7014	7023	60 %	20 %	0 %	20 %	384888502
157	NC_017383	ACA	2	6	7084	7089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888502
158	NC_017383	CAAG	2	8	7092	7099	50 %	0 %	25 %	25 %	384888502
159	NC_017383	CTT	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384888502
160	NC_017383	ACA	2	6	7266	7271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384888502
161	NC_017383	GA	3	6	7317	7322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.